Pertenecen al mismo Proyecto.
No tienen que estar en el mismo lugar.
Estás lanzando un sitio web. El código está en un repositorio Git, la investigación en Documentos y los informes de trabajo, en otro lugar.
Parte de ese trabajo debería permanecer fuera del repositorio de código y de sus commits.
Crea un Proyecto en Foundry Core e incluye lo que le pertenece, sin moverlo de donde está.